[1]李慧,李宇飞,孟子育,等.螭霖鱼肠道微生物多样性分析[J].水产养殖,2020,41(08):1-6.
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螭霖鱼肠道微生物多样性分析
《水产养殖》[ISSN:1004-2091/CN:32-1233/S]
- 卷:
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41
- 期数:
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2020年08期
- 页码:
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1-6
- 栏目:
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研究与综述
- 出版日期:
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2020-08-01
文章信息/Info
- 作者:
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李慧; 李宇飞; 孟子育; 郁家宝; 赵永正; 夏倩倩; 孟超; 田园
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(山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东 泰安 271016)
- 关键词:
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螭霖鱼; 测序; 16S rRNA
- 摘要:
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分析螭霖鱼肠道微生物的群落结构组成及多样性差异,研究其与其肠道内共生微生物的协同进化关系。提取螭霖鱼的肠道内容物及粪便微生物DNA样本,利用高通量测序技术进行16S V4区域扩增子测序以及生物信息学分析,共得到250 958条序列。基于97%的样本相似度,样本优化聚类为1200个OTU(Operational taxonomical unit),共涉及13门24纲42目56 科75属。在属水平上黄杆菌属(Flavobacterium)(44.72%)、蓝黑紫色杆菌属(Janthinobacterium)(14.08%)和气单胞菌属(Aeromonas)(9.29%)为主要优势菌群,其余菌种所占比例不大。螭霖鱼肠道内微生物群落组成较为相似,无统计学意义差异。
更新日期/Last Update:
2020-08-08