3种气单胞菌鉴定方法的比较-《水产养殖》

文章信息/Info

作者:: 杨致旭¹; 王楠楠^1*; 沈广龙²; 吴亚锋³; 方光远¹; 郭宇飞¹; （1.金陵科技学院动物科学与食品工程学院，江苏南京 210038；2.南京康旭科技有限公司，江苏南京 211300；3.江苏省水生动物疫病预防控制中心，江苏南京 210036）

摘要:: 采用分子生物学检测方法、API 20NE生化鉴定法以及梅里埃（VITEK MS）全自动快速微生物质谱检测法，对60株试验菌株进行种属鉴定，比较3种鉴定方法的准确性和优缺点。对试验菌株进行16S rDNA特异性引物扩增和测序，确定菌株种属，并作为比较3种鉴定方法的标准。随后用API 20NE生化鉴定法和梅里埃（VITEK MS）全自动快速微生物质谱检测法，对试验菌株进行鉴定。结果显示，分子生物学方法和生化鉴定法，对60株菌的检出率均为100%，而质谱仪的检出率仅为60.0%。使用分子生物学法共检出44株气单胞菌（100%），准确率为100%；使用生化鉴定法对气单胞菌的检出率为88.6%，准确率为59.1%；使用质谱仪对气单胞菌的检出率为54.5%，准确率为38.6%。3种鉴定方法对气单胞菌的检出率和准确率从大到小为：分子生物学法、API 20NE生化鉴定、质谱仪。